代理記賬的收費方式也有不同，有的是按月，有的是按年。所以在進行了解的時候一定要確定方式，其實按年一次性繳納費用，這種方法是比較劃算的。
比如，公司的營業(yè)收入越高，公司的往來業(yè)務也就越多，代理記賬公司為該客戶公司承擔的財務風險也越大。因此，企業(yè)日常經營過程中，財務來往所獲得的收入情況，也是重要的考量。營業(yè)收入越高，代理服務費用也相應會越高。每月財務工作多且難度大，費用自然更高。
代理記賬公司處理過程中遇到的公司應交稅為負數的問題該怎么解決呢？一般來說，解決辦法很簡單。，增值稅可以用于公司日后稅務的抵押，一般可以不做處理。這其中還得分為兩種情況。種呢，是少計提了稅金，則必須由公司相關人員出面來補計提。第二種是多余的金額用以抵押日后的稅金，要向有關部門即稅局進行申請。
當然就是基本的接受委托人的委托請求之后確定了具體的服務項目，之后就是確定委托費用、簽訂委托代理合同以及建立客戶的檔案。
